Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CRXO43186 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CRXO43186 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CRXO43186 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CRXO43186 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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