Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2SURPO15042 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms