Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms