Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN8O00124 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms