Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCER2I3L3R5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms