Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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