Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms