Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms