Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms