Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM200CA6NKL6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms