Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms