Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms