Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSDA5PKW4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms