Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms