Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SERP1Q9Y6X1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms