Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms