Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIF3AQ9Y496 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms