Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP3Q9Y446 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms