Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms