Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms