Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms