Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DTX4Q9Y2E6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms