Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms