Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms