Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD1Q9UP38 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms