Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ABCG2Q9UNQ0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ABCG2Q9UNQ0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms