Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA11Q9UKX5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms