Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms