Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GMEB2Q9UKD1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms