Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FBXL4Q9UKA2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms