Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD1Q9UIS9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms