Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATPIF1Q9UII2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms