Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT172Q9UG01 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms