Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN8Q9UBY8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms