Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms