Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPS29Q9UBQ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms