Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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