Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms