Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms