Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms