Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN3Q9P232 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN3Q9P232 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms