Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC88CQ9P219 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms