Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms