Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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