Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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RDH8Q9NYR8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RDH8Q9NYR8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RDH8Q9NYR8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RDH8Q9NYR8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RDH8Q9NYR8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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