Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VNN3Q9NY84 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms