Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms