Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATAD3AQ9NVI7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms