Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms