Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms